Os produtos para cromatografia não são diretamente responsáveis pela limpeza de efluentes. No entanto, é graças à técnicas como a de cromatografia líquida acoplada a espectrometria de massas (LC-MS), cromatografia gasosa acoplada a espectrometria de massas (GC-MS) e cromatografia iônica que laboratórios do segmento podem desenvolver painéis de contaminantes de modo a qualificar amostras de água como potáveis ou direcionar estratégias de tratamento para torna-las aptas para consumo.
A portaria 888 de 4 maio de 2021 identifica os principais contaminantes e seus limites máximos de contaminação em água. Ao passo que o norma se encontra bem completa, muito trabalho deve ser feito de modo a eliminar a presença de contaminantes emergentes, como é o caso das chamadas substâncias alquílicas perfluoradas (PFASs).

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